南京大学苏州研究生院2003年12月获教育部正式批准，是以培养研究生为主要任务的教育机构。于2005年6月8日正式揭牌，面向苏州市经济和社会发展特别是苏州工业园区高新技术产业发展的需要，探索和发展新型的人才培养和科技创新方面的合作机制，更好地为江苏地方经济发展服务。

南京大学高新技术研究院2009年7月成立，目前自己引进并孵化的高新科技企业20余家，注册资本超2.1亿元。研发平台5个，包括市级重点实验室——苏州基础工程分布式传感监测技术重点实验室1个。涉及分布式光电传感监测、生态与环境保护、生物制药和纳米技术等领域。